More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4904 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  500  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  58.91 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  57.59 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  56.3 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  48.5 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  54.86 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  48.5 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  57.31 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  58.89 
 
 		 260 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  53.15 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  47.74 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 277 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  53.36 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 274 aa  261  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  49.01 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  56.92 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  51.38 
 
 		 284 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  53.7 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  49.01 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  54.18 
 
 		 286 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  53.75 
 
 		 271 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  47.43 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  49.8 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  52.76 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  52.57 
 
 		 257 aa  255  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  51.36 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  49.42 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  52.36 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  51.17 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  52.96 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  49 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 277 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  42.06 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  47.86 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  47.43 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  52.17 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  50.61 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 265 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  49.81 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  47.24 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  43.02 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  43.02 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  48.64 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  46.3 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  52.76 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  48.65 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  48.43 
 
 		 285 aa  244  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  45.85 
 
 		 286 aa  244  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  46.67 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  46.25 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  48.24 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  52.92 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 267 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4513  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 		 302 aa  241  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  52.92 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  54.15 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  44.88 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  46.06 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  40.94 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3058  ABC transporter related  55.29 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0667056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  50.39 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  54.94 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 271 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.81 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.72 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  46.69 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>