More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1803 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  71.92 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10180  ferric enterobactin transport protein FepC  75.19 
 
 		 265 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0235385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  68.08 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  65.76 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  64.09 
 
 		 292 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  64.53 
 
 		 265 aa  334  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  64.2 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  63.88 
 
 		 265 aa  330  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4085  ABC transporter related  66.67 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0156292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.15 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  62.55 
 
 		 267 aa  328  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  60.77 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  65.13 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  60.77 
 
 		 271 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  65 
 
 		 269 aa  323  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  61.07 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  62.07 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  61.33 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  62.79 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 264 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  59.62 
 
 		 266 aa  319  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  62.84 
 
 		 303 aa  317  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2691  ABC transporter related protein  64.57 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  61.63 
 
 		 271 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  60.94 
 
 		 292 aa  314  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  61.69 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  61.48 
 
 		 330 aa  312  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  59.92 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  61.42 
 
 		 279 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  64.59 
 
 		 267 aa  309  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2720  ABC transporter related  60.55 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  58.94 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0646  ABC transporter related protein  66.28 
 
 		 270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  63.46 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2746  ABC transporter related protein  61.33 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425964  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  60.7 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  60.39 
 
 		 263 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5111  ABC transporter related protein  62.06 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  58.91 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  55.51 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  57.81 
 
 		 282 aa  295  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  56.15 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  55.51 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  57.03 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  60.16 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  58.33 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  55.85 
 
 		 273 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  56.86 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  53.38 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  55.3 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  57.42 
 
 		 625 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  57.36 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  51.37 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  53.85 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  57.37 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  52.31 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  52.33 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  52.31 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  57.75 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  51.92 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  51.92 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  51.92 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  51.56 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3186  ferric enterobactin ABC transporter ATP-binding protein FepC  55.29 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0584724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2444  ferric enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein FepC  55.29 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2543  ABC transporter related  55.29 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  55.38 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  55.56 
 
 		 283 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  51.56 
 
 		 286 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  56.64 
 
 		 271 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3783  ABC transporter related protein  59.68 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  54.51 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  52.71 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  52.9 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  56.59 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  52.76 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  54.69 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>