More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4301 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  91.44 
 
 
257 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  91.44 
 
 
257 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  75.69 
 
 
261 aa  345  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  70.77 
 
 
261 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  56.98 
 
 
260 aa  291  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  52.14 
 
 
278 aa  264  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  49.2 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  53.46 
 
 
265 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  46.67 
 
 
269 aa  250  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  58.92 
 
 
261 aa  245  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 
257 aa  236  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  47.45 
 
 
285 aa  236  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  236  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  45.63 
 
 
277 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  49.81 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 
256 aa  232  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  49.8 
 
 
271 aa  230  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  46.12 
 
 
276 aa  229  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  56.63 
 
 
274 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  43.7 
 
 
268 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  49.6 
 
 
278 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 
322 aa  228  7e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 
277 aa  227  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  43.21 
 
 
258 aa  224  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  49.6 
 
 
261 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  46.4 
 
 
266 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  46.83 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  47.04 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  46.64 
 
 
263 aa  214  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.64 
 
 
263 aa  214  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  41.57 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  49.6 
 
 
266 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  40.15 
 
 
259 aa  208  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  50.84 
 
 
257 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  46.25 
 
 
253 aa  207  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
269 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  42.69 
 
 
256 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  40.23 
 
 
262 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
245 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  41.08 
 
 
260 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
290 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
252 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  45.49 
 
 
257 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  41.25 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
252 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  47.24 
 
 
264 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.67 
 
 
260 aa  191  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  41.08 
 
 
259 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 
261 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  37.86 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
257 aa  189  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
275 aa  188  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  45.63 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.28 
 
 
269 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.49 
 
 
268 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  43.8 
 
 
274 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.24 
 
 
264 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 
265 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.05 
 
 
258 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.72 
 
 
229 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 
264 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.45 
 
 
268 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  43.75 
 
 
256 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  176  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  42 
 
 
259 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  36.07 
 
 
266 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  40 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.74 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  43.04 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  46.81 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.62 
 
 
409 aa  171  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.69 
 
 
418 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.69 
 
 
262 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  43.1 
 
 
424 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  45.68 
 
 
255 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.15 
 
 
262 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
266 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  45.9 
 
 
267 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.66 
 
 
266 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.73 
 
 
259 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  43.21 
 
 
275 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  40.89 
 
 
266 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  45.78 
 
 
260 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 
260 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.76 
 
 
285 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.74 
 
 
270 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  38.93 
 
 
290 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  42.34 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  38.33 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
256 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  41.77 
 
 
256 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
257 aa  165  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  42.06 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>