More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0560 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  51.76 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  46.06 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 		 311 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  50.78 
 
 		 384 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  50.84 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  44 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  48.5 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  47.01 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  54.98 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  46.18 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  46.18 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  46.18 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  43.43 
 
 		 326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  49.16 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  43.03 
 
 		 279 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  44.88 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  43.43 
 
 		 321 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  43.43 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 263 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  46.47 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  49.36 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  46.86 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.89 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.19 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  50.7 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.05 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.43 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.58 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  41.04 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  41.04 
 
 		 297 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  41.04 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  41.04 
 
 		 297 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  47.66 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  42.86 
 
 		 307 aa  208  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  47.84 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  40.39 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  48.03 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  42.8 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.56 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  49.6 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  47.6 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  42.63 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  39.22 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  38.13 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  43.46 
 
 		 409 aa  193  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  50.2 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.22 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  44.31 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  39.29 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  45.49 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.97 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  49.1 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.08 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  35.29 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  38.17 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  42.28 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.19 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.07 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  38.17 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  43.32 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  44.44 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  40.51 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  43.46 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  47.06 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  46.03 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.17 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  41.52 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  40.44 
 
 		 286 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.39 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  48.05 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.22 
 
 		 265 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  46.44 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>