More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0231 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  100 
 
 
266 aa  513  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  67.07 
 
 
294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
275 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  39.76 
 
 
255 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  45.28 
 
 
269 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.69 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 
255 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  45.53 
 
 
285 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  39.68 
 
 
272 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.34 
 
 
418 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
256 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
272 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
272 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
272 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  40 
 
 
455 aa  184  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.52 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  42.69 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  47.6 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
272 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  42.29 
 
 
259 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
273 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  41.27 
 
 
269 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  41.27 
 
 
269 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.87 
 
 
255 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
255 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  40.89 
 
 
254 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  38.46 
 
 
273 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
273 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
273 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 
255 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.87 
 
 
255 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  44.31 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  44.8 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  45.64 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
273 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
273 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 
255 aa  178  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
273 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  48.13 
 
 
257 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
273 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  45.27 
 
 
262 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
271 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.68 
 
 
262 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 
261 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
263 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  46.09 
 
 
273 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  44.67 
 
 
271 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.17 
 
 
262 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  42.98 
 
 
253 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  44.07 
 
 
254 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  44.86 
 
 
265 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.56 
 
 
266 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  44.59 
 
 
271 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  40.32 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  40.83 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  45.27 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  44.02 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  41.11 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  43.41 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  36.51 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  44.07 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  48.94 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.15 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  44.59 
 
 
421 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  42.26 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  40.91 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1419  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 
268 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.89 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  41.48 
 
 
414 aa  171  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  43.16 
 
 
254 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  42.22 
 
 
262 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  41.7 
 
 
254 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  41.25 
 
 
266 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  43.75 
 
 
254 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.53 
 
 
258 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.75 
 
 
271 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  40.5 
 
 
427 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.8 
 
 
268 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4898  ABC transporter-like  43.98 
 
 
263 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  0.0112209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
274 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  40.25 
 
 
307 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  38.75 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  40.55 
 
 
283 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 
265 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  38.66 
 
 
265 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  38.66 
 
 
265 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  44.44 
 
 
262 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  42.26 
 
 
264 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>