More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4828 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  48.43 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  50 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  44.8 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  49.61 
 
 		 262 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  46.4 
 
 		 308 aa  228  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  49.79 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  48.24 
 
 		 384 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  46.59 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  46.59 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  46.59 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  45.45 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  51.76 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  43.43 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.31 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  46.86 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.2 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  43.31 
 
 		 311 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.53 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  42.4 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.4 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  47.7 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.58 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  42.4 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  42.4 
 
 		 321 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.41 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  41.11 
 
 		 297 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.77 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  41.11 
 
 		 297 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  41.11 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  41.11 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  46.67 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  41.5 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  46.51 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  43.46 
 
 		 409 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  40.8 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  36.61 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  44.96 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.64 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.1 
 
 		 339 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  46.94 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.63 
 
 		 289 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.17 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.32 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40.39 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  43.1 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  41.2 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.92 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.24 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.08 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  41.91 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  38.59 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  40.43 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  38.1 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.13 
 
 		 490 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  44.3 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  41.28 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.39 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  42.74 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.34 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  43.35 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  42.74 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.02 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  38.24 
 
 		 286 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  41.6 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  41.49 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  40.51 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  42.75 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.32 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  39.74 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  42.13 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.08 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>