More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3325 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  100 
 
 
257 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0175  ABC transporter related  49.36 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  48.93 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0548  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3577  ABC transporter related  45.63 
 
 
271 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2772  ABC transporter related  45.57 
 
 
289 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 
251 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.08 
 
 
285 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  46.64 
 
 
257 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  43.64 
 
 
254 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  38.28 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  35.71 
 
 
269 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  41.5 
 
 
285 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  42.13 
 
 
254 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  41.15 
 
 
261 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.88 
 
 
339 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 
261 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
264 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.12 
 
 
266 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
264 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  36.51 
 
 
321 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  39.33 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  44.68 
 
 
254 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 
311 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  36.59 
 
 
253 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  42.08 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  46.95 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  43.64 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  41.7 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  37.65 
 
 
307 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  36.11 
 
 
321 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  36.11 
 
 
326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
265 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  42.11 
 
 
280 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  34.25 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  40.76 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  43.27 
 
 
255 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  36.65 
 
 
283 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  33.59 
 
 
276 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
261 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  35.32 
 
 
308 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  34.8 
 
 
279 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
253 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.19 
 
 
268 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 
324 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  41.46 
 
 
271 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
274 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.61 
 
 
271 aa  158  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  41.41 
 
 
259 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.74 
 
 
268 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.72 
 
 
264 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  40.78 
 
 
273 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.97 
 
 
285 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.53 
 
 
259 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.81 
 
 
260 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  38.14 
 
 
253 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.15 
 
 
266 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  40.16 
 
 
266 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  37.89 
 
 
384 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7397  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
290 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  37.76 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  34.52 
 
 
409 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.38 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 
267 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  40.62 
 
 
252 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  43.22 
 
 
257 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  33.47 
 
 
259 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  47.96 
 
 
270 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.09 
 
 
253 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
490 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.31 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  43.5 
 
 
263 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
265 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
263 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  42.5 
 
 
291 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  38.85 
 
 
264 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  44.35 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  44.02 
 
 
257 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
315 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  41.46 
 
 
261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  41.46 
 
 
261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  44.49 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.15 
 
 
257 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  41.46 
 
 
261 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  41.02 
 
 
256 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
256 aa  152  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>