More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0175 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0175  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  526  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  92.83 
 
 		 265 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3577  ABC transporter related  53.12 
 
 		 271 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0548  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  45.57 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2772  ABC transporter related  43.87 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.91 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  40.16 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  41.67 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  41.67 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  37.6 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  42.02 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.72 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  41.3 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  41.3 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  42.98 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  43.1 
 
 		 321 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  43.1 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  42.54 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  41.63 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  42.02 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  42.24 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.57 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.16 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  40.93 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  43.51 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.53 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  43.35 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  42.74 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.77 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  41.38 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  39.48 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.75 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  40.87 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  38.52 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.93 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  39.66 
 
 		 308 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  39.74 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  39.75 
 
 		 490 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  39.15 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.51 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  40.43 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  38.76 
 
 		 297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.38 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  38.76 
 
 		 297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.31 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  40.43 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  38.76 
 
 		 297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  37.6 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  38.76 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  40.17 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  39.13 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  40.53 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  42.19 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  44.39 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.87 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  37.9 
 
 		 283 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  33.2 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  39.66 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  43.22 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.16 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  40.98 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  39.66 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  39.66 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  39.39 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  39.66 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  37.12 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3978  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>