More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0995 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  497  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  77.25 
 
 		 255 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  74.51 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  74.51 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  77.25 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  76.08 
 
 		 255 aa  359  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  76.86 
 
 		 255 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  71.76 
 
 		 255 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  71.37 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  50.79 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  47.83 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  50.19 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  47.43 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  47.04 
 
 		 288 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  42.47 
 
 		 269 aa  197  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  44.88 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  41.94 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  43.58 
 
 		 424 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.48 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.57 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 536 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.35 
 
 		 414 aa  188  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  47.77 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  45.61 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 418 aa  184  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  41.02 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  41.02 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.41 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  45.61 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 490 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  41.09 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.6 
 
 		 418 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40.83 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.67 
 
 		 455 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  47.76 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.41 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  43.51 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  43.92 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.27 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  40.46 
 
 		 282 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  46.25 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.62 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  45.75 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.41 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.46 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3243  ABC transporter related  47.9 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.28 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.77 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  36.68 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  42.22 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  43.9 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  44.96 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  43.95 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.41 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.87 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.92 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  44.14 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.74 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  45.11 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  42.64 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  42.64 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  42.64 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  42.25 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.6 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  42.19 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  43.27 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  39 
 
 		 419 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.38 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>