More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2305 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  100 
 
 
276 aa  530  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  62.69 
 
 
265 aa  295  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.2 
 
 
267 aa  261  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  49.41 
 
 
254 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 
266 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  50.19 
 
 
267 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  51.72 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  48.28 
 
 
260 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  47.48 
 
 
260 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  48.82 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  47.48 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  42.47 
 
 
409 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 
266 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
266 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  44.53 
 
 
255 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
255 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  44.53 
 
 
255 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  44.53 
 
 
255 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.34 
 
 
424 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  44.13 
 
 
255 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  46.58 
 
 
264 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
256 aa  165  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  51.89 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  46.74 
 
 
271 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
266 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  40.74 
 
 
455 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.17 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
264 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
264 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
264 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
264 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.68 
 
 
258 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
265 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.13 
 
 
302 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
264 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  42.21 
 
 
259 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40 
 
 
536 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.3 
 
 
268 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 
267 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.64 
 
 
262 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  38.24 
 
 
264 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  46.58 
 
 
271 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.15 
 
 
625 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.5 
 
 
251 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
266 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  44.9 
 
 
262 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  44.04 
 
 
268 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
490 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.86 
 
 
266 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  41.27 
 
 
259 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
263 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  40.24 
 
 
254 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  47.44 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.42 
 
 
290 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  35.63 
 
 
265 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  45.41 
 
 
271 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
293 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.86 
 
 
266 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  35.63 
 
 
265 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  45.75 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  43.75 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
262 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  38.91 
 
 
253 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.33 
 
 
268 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 
260 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.06 
 
 
263 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
272 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  35.1 
 
 
254 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  45.92 
 
 
257 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
276 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  41.46 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
273 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  38.31 
 
 
259 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  47.6 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
259 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  47.6 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  37.39 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  41.31 
 
 
286 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  45.66 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
264 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  34.82 
 
 
259 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  47.6 
 
 
282 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>