More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0511 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  52.36 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  49.81 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  51.15 
 
 		 271 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  48.25 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  47.22 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  46.64 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  44.49 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  52.54 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  45.82 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  47.22 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  45.06 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  47.01 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  45.45 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 536 aa  192  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  46.47 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  50.21 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.92 
 
 		 424 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  46.15 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  42.29 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  49.15 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.13 
 
 		 405 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  41.6 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  48.05 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.72 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  39.2 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  49.34 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  48.65 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  42.54 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  39.59 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 490 aa  174  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  47.27 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  40.51 
 
 		 419 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  40.94 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.33 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.71 
 
 		 424 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.63 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.62 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  41.77 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.04 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  42.54 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.04 
 
 		 418 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.6 
 
 		 409 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  37.08 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  36.29 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.92 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.28 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  38.82 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  39.06 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  40.95 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  43.16 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.67 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  40.57 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.65 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  35.97 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  32.2 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  37.5 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  43.98 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  37.66 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  38.61 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  37.66 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  32.3 
 
 		 416 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  30.08 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  40.51 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  38.14 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  41.46 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  42.13 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  41.06 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  44.59 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  36.97 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  42.26 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  44.68 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>