More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0747 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  88.63 
 
 		 255 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  88.24 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  87.45 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  76.86 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  73.33 
 
 		 255 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 		 255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  74.51 
 
 		 255 aa  347  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  44.79 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  48.82 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  45.18 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  46.92 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 288 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  44.53 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  44.35 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  40.56 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.8 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  40.3 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.02 
 
 		 536 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  36.58 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  39.22 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.55 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.39 
 
 		 424 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 490 aa  174  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  44.68 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.15 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  40.15 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.11 
 
 		 455 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  42.22 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.74 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  36.33 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  43.23 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  40.15 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.05 
 
 		 418 aa  168  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  37.96 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.38 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  40.82 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  39.92 
 
 		 494 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.67 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  44.35 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  46.67 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  43.15 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.67 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.33 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  40.41 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3243  ABC transporter related  44.12 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  37.89 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.37 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.77 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40.77 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.43 
 
 		 409 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 273 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.15 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.27 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  44.17 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>