More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3151 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  95.57 
 
 		 271 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  71.91 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  71.16 
 
 		 271 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  72.08 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  65.92 
 
 		 270 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  48.05 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  50.59 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  51.78 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  49.21 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  51.57 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  44.57 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  51.63 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  48.13 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  47.2 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  47.45 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  46.56 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  52.04 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  47.15 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  49.58 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  49.15 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.63 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  36.63 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 536 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  40.8 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.98 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.78 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  42.44 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.25 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.43 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  39.22 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37 
 
 		 405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  43.18 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  45.28 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  43.93 
 
 		 424 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  43.43 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  34.94 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  38.24 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.24 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.46 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  37.84 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.43 
 
 		 409 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  42.21 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  45.96 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.02 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  36.9 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.97 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  45.99 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  41.96 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.7 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.92 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  39.83 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  40.85 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  38.58 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  42.91 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  44.49 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  51.34 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  42.34 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  46.24 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  38.33 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.24 
 
 		 414 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  33.72 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  41.8 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  39.45 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  39 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  42.91 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  41.5 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  42.91 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  42.91 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.77 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  49.06 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  39.66 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  42.52 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.46 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  42.52 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>