More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1342 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  46.64 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  45.06 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  45.6 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  47.06 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  44.49 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  41.18 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  44.44 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  41.08 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  42.35 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  41.5 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  44.86 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  40.55 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  40.86 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39 
 
 		 490 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  41.39 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  46.64 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  48.13 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  46.38 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  41.49 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  41 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  39.5 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 536 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.44 
 
 		 405 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.17 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  39.61 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  43.98 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.2 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  40.69 
 
 		 419 aa  165  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  40.25 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  33.47 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  41.18 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  35.71 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0753  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  31.28 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  42.32 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.94 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  40.08 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.67 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  29.15 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  34.31 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.53 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.25 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  39 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  38.17 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  42.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  29.54 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.72 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.72 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.72 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  38.11 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  38.22 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.43 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.3 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  33.86 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  33.86 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  39.67 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  38.39 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  37.6 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  36.67 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  38.52 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  38.53 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  40.59 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  29.84 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  36.25 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.49 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  40.83 
 
 		 276 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  39.75 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  41.98 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.56 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  40.41 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  39.06 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  40.51 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  45.21 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  30.67 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  30.67 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  37.9 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  37.1 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  38.52 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>