More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4687 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  98.43 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  93.73 
 
 		 255 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  88.24 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  68.24 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  71.37 
 
 		 255 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  68.63 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  68.63 
 
 		 255 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  45.95 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  49.61 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  48.65 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.09 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  44.69 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.11 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  44.35 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 277 aa  187  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 536 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.16 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.89 
 
 		 455 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 424 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.82 
 
 		 418 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.02 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.28 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.41 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  42.86 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  43.22 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.04 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  44.72 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  43.17 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.74 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  38.78 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  45.04 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.89 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.13 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.27 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  42.17 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  41.54 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  44.98 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  40.93 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.26 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.39 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.3 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  44.05 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  40.39 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.78 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.32 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  35.91 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.58 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 		 418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.43 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.82 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.7 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.82 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  37.11 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>