More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0257 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  61.25 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  52.36 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  48.05 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  48.64 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  48.22 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  48.21 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  47.86 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  45.42 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  49.79 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  47.01 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  46.34 
 
 		 260 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  45.45 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  43.82 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  44.75 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.71 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.71 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 536 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  42.13 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.92 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  43.58 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 490 aa  188  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  37.87 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  45.8 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  48.02 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  45.7 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.13 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.32 
 
 		 414 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  43.31 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  42.11 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  39.58 
 
 		 424 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.59 
 
 		 418 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  45.28 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  45.35 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  41.5 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  36.29 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  39.53 
 
 		 419 aa  178  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  41.5 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.86 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  44.39 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.98 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  37.13 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  37.77 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  37.77 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.49 
 
 		 271 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.02 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.17 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.58 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.71 
 
 		 424 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  38.66 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  39.75 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  44.57 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  45.29 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.31 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  37.14 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  41 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  37.86 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.99 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  34.6 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  35.91 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0562  ABC transporter related  35.43 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  36.73 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  38.82 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  44.77 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  41.67 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  41.42 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.6 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>