More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8853 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  61 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  58.54 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  52.34 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  54.02 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  54.58 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6327  ABC transporter related protein  53.79 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.52 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  44.96 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  44.22 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  43.1 
 
 		 274 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.85 
 
 		 418 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.21 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.97 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40.08 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  46.22 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  45.64 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.28 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.25 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  40.16 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  46.96 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.89 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.47 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  42.29 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.15 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 490 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0075  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein fecE  34.3 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.71 
 
 		 405 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  40.49 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.98 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  40.91 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.47 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.87 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.47 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  44.98 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  35.23 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  35.23 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  40.6 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.88 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  38.17 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  44.18 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  40.87 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  40.87 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  39.38 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  40.43 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  38.31 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  37.14 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  39.91 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  39.23 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.37 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  41.85 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  46.64 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.9 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  36.73 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  41.77 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  41.77 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  37.94 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  39.91 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  36.9 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  40.8 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  38.59 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  41.67 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  45.58 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  35.22 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>