More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1542 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  67.06 
 
 		 260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  67.06 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  63.92 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  60.24 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  62.3 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  64.45 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  61.87 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  53.31 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  44.88 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  45.45 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  47.54 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.92 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  43.68 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.86 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  41.3 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  42.37 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  37.72 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  37.72 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  44.08 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  37.19 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  43.44 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  34.78 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  41.15 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.83 
 
 		 424 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  42.55 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  41.06 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  40.29 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  42.37 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.46 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  38.46 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  40.29 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.66 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  42.04 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  42.26 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  42.37 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  40.77 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  41.13 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  40.91 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  41.18 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.28 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  41.28 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  39.47 
 
 		 282 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  41.95 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.13 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  35.41 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.73 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  36.44 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 536 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  39.77 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  39.77 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2394  ABC transporter related  31.47 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0360608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.82 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0371  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATPase component  35.43 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.140536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  39.61 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  40.08 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  29.37 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  42.13 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  40.62 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.27 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  37.76 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  38.02 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  28.57 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.56 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  35.52 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  41.25 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>