More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1206 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  51.74 
 
 		 271 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  52.53 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  50.2 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  45.42 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  42.8 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  47.64 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  47.64 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  46.64 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  45.56 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  45.1 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  42.59 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  40.78 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  43.85 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  44.92 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  43.14 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  42.35 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  42.13 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  48.73 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  42.13 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  47.83 
 
 		 256 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  49.78 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  44.98 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  42.23 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  38.37 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  39.04 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  37.5 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.57 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  49.15 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  36.4 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  45.24 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  37.6 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  39.76 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  38.04 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.87 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  39.37 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  39.76 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  35.86 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  40.62 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  44.86 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.51 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  38.98 
 
 		 444 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  41.18 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.8 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  46.96 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.95 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  42.5 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  43.15 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  38.8 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.7 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  39.29 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.92 
 
 		 414 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  36.76 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  42.13 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  39.43 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  36.67 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  37.35 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  38 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  38.89 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.02 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  40 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.3 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  40.42 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  37.76 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.83 
 
 		 339 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  37.24 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.5 
 
 		 418 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.05 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  36.19 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0298  ABC transporter related  40.41 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>