More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2552 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  510  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  72.66 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  69.29 
 
 		 254 aa  348  5e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  69.69 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  62.11 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  62.11 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  64.84 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  61.22 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  48.28 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  41.06 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  44.58 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  43.98 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  40 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  43.78 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 490 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  42.46 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  41.94 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  45.38 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  42.58 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  45.41 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  43.7 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  41.52 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  39.75 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  38.89 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  30.74 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  30.74 
 
 		 266 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 536 aa  148  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  42.98 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.46 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  35.22 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  40.74 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.53 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  36.68 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  41.08 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0371  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATPase component  35.87 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.140536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  40.17 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  36.68 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  41.98 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  38.82 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  42.53 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  37.55 
 
 		 424 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.56 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  42.39 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  40.08 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.54 
 
 		 424 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  36.73 
 
 		 414 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 263 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.84 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.2 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.55 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.83 
 
 		 285 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.8 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  34.22 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  39.85 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  40 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  42.61 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  40.24 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  42.61 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  42.61 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.06 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  36.59 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  30.71 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  33.85 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  42.61 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.41 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  42.61 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  31.36 
 
 		 405 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  38.19 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  35.16 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  41.84 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  44.3 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  40.42 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  42.17 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 282 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.33 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  40.99 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>