More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3013 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 282 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  47.08 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  47.08 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  47.41 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  47.01 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  36.78 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  47.01 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  45.2 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  43.85 
 
 		 265 aa  201  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  47.01 
 
 		 282 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  42.86 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  43.64 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3322  iron ABC transporter, ATP binding protein FitB  44.03 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  41.74 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  44.21 
 
 		 285 aa  198  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.27 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  40 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4342  iron ABC transporter, ATP binding protein FitB  43.62 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  43.28 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.23 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 293 aa  195  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  47.43 
 
 		 287 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  42.29 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  43.82 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.94 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  41.11 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  43.39 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  41.73 
 
 		 284 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  42.91 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3058  ABC transporter related  46.61 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0667056 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3413  ABC Fe+3-siderophore transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.98 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.49 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  46.47 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  38.91 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  40.6 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3140  ABC transporter related  45.8 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364263  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.67 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  39.52 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.67 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  39.6 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  46.73 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  40.78 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 296 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  44.22 
 
 		 296 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 296 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  38.71 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  39.2 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  44.4 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2759  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.078515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.4 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  38.71 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  38.71 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  39.84 
 
 		 283 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  39.09 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0646  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1050  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40.6 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>