More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4342 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4342  iron ABC transporter, ATP binding protein FitB  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3322  iron ABC transporter, ATP binding protein FitB  98.88 
 
 
269 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  83.58 
 
 
269 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50.57 
 
 
271 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  50.6 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  49.01 
 
 
285 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
277 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  50.59 
 
 
270 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  46.85 
 
 
267 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  47.53 
 
 
273 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  47.64 
 
 
278 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  48 
 
 
265 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  48.08 
 
 
281 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  48.8 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  46.48 
 
 
263 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  48.47 
 
 
271 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  50.4 
 
 
260 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 
270 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  47.53 
 
 
284 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  48.8 
 
 
264 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  48.41 
 
 
278 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  45.67 
 
 
269 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
273 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  46.37 
 
 
273 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
264 aa  247  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  48.43 
 
 
280 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  49.39 
 
 
270 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 
273 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
273 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
273 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 
273 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
260 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
276 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  46.37 
 
 
273 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  46.59 
 
 
265 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
273 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
277 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  46.4 
 
 
271 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  244  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
273 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
293 aa  244  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  244  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  45.97 
 
 
273 aa  244  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  46.8 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  48.21 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  48.21 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  47.41 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  47.45 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 
270 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  45.67 
 
 
270 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  46.8 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  47.66 
 
 
266 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.2 
 
 
625 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  46.62 
 
 
292 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
270 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2691  ABC transporter related protein  49.81 
 
 
271 aa  241  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
274 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  48 
 
 
271 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  50.39 
 
 
284 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  48.03 
 
 
287 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  46 
 
 
273 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  47.76 
 
 
303 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.38 
 
 
258 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  44.36 
 
 
284 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  47.18 
 
 
286 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  44.8 
 
 
283 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  45.45 
 
 
271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
271 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.08 
 
 
302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
265 aa  232  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  47.15 
 
 
274 aa  232  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  44.62 
 
 
290 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  47.52 
 
 
267 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.8 
 
 
273 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  44.18 
 
 
265 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  44.18 
 
 
265 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
263 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  44.67 
 
 
275 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.53 
 
 
290 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  46.94 
 
 
269 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  44.44 
 
 
268 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  46 
 
 
269 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3058  ABC transporter related  46.88 
 
 
266 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0667056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  42.74 
 
 
285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
267 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3413  ABC Fe+3-siderophore transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 
266 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
271 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  43.03 
 
 
271 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2746  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
266 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425964  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
271 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
271 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>