More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3413 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3413  ABC Fe+3-siderophore transporter, ATPase subunit  100 
 
 
266 aa  523  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3058  ABC transporter related  98.5 
 
 
266 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0667056 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  83.08 
 
 
267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  73.56 
 
 
271 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  72.24 
 
 
278 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  76.43 
 
 
287 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  71.32 
 
 
277 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  72.24 
 
 
280 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  65 
 
 
269 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  64.91 
 
 
293 aa  342  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  64.98 
 
 
271 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  66.54 
 
 
270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  61.24 
 
 
625 aa  313  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  58.37 
 
 
267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  58.53 
 
 
263 aa  310  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  61.94 
 
 
271 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  56.69 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  56.3 
 
 
269 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  61.3 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  57.25 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  62.75 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  55.43 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  56.86 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  58.05 
 
 
303 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  55.6 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  60 
 
 
282 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  58.5 
 
 
292 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  59.27 
 
 
290 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  58.14 
 
 
330 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  54.72 
 
 
273 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  56.92 
 
 
292 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  59.29 
 
 
278 aa  295  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  59.06 
 
 
302 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  58.87 
 
 
285 aa  294  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  58.56 
 
 
275 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  60 
 
 
260 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.36 
 
 
266 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  56.92 
 
 
266 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  57.98 
 
 
274 aa  291  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
264 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
264 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
264 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  54.65 
 
 
284 aa  290  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
264 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
264 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  53.28 
 
 
281 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  51.38 
 
 
286 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 
271 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  52.96 
 
 
271 aa  288  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
271 aa  288  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 
271 aa  288  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 
271 aa  288  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  52.96 
 
 
271 aa  288  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 
271 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  58 
 
 
264 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
271 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  54.15 
 
 
267 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  59.13 
 
 
269 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  51.15 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2691  ABC transporter related protein  61.2 
 
 
271 aa  285  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  54.23 
 
 
270 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  51.15 
 
 
273 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  59.92 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  50.77 
 
 
273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  60.77 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  58.04 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  50.77 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  52.71 
 
 
263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  50.77 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  48.67 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  55.04 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 
273 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  54.72 
 
 
257 aa  280  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  50.97 
 
 
284 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
276 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  57.89 
 
 
286 aa  278  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  50.38 
 
 
283 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  60.55 
 
 
268 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  60.25 
 
 
267 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  51.72 
 
 
271 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
265 aa  271  6e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4085  ABC transporter related  60.98 
 
 
264 aa  271  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0156292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  48.85 
 
 
269 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  56.33 
 
 
283 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  56.03 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
267 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  49.21 
 
 
277 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  53.1 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2746  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
266 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425964  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5111  ABC transporter related protein  57.36 
 
 
262 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
260 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>