More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4079 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  100 
 
 		 269 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  89.31 
 
 		 271 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6327  ABC transporter related protein  65.12 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  57.69 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  56.42 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  55.12 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  57.48 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.07 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.51 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.43 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  44.98 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  47.9 
 
 		 419 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.74 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.55 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.19 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  39.85 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.14 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  40.33 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.6 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.91 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  43.98 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.08 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  40.23 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  42.42 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  40.42 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  40.82 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.7 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  44.1 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  44.87 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  43.64 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  44.1 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  42.05 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  44.1 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  37.74 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.8 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.8 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  35.86 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1712  ABC transporter related  39.59 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 536 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.8 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  41 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  43.93 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  31.95 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.5 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.32 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  39.39 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 490 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.47 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  34.13 
 
 		 455 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  41.46 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  36.64 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  36.64 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4513  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.83 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  39.17 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  43.22 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  42.8 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  43.36 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 274 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 274 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  39.15 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.76 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  42.26 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.92 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  41.63 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  41.32 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.67 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  39.04 
 
 		 427 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>