More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1233 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  100 
 
 
271 aa  520  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  72.44 
 
 
301 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  65.49 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  61 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  57.98 
 
 
271 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  57.69 
 
 
269 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  55.42 
 
 
258 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6327  ABC transporter related protein  54.3 
 
 
283 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  43.2 
 
 
269 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.01 
 
 
418 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.92 
 
 
253 aa  191  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  43.92 
 
 
290 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  45.82 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  41.38 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
255 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
536 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  46.41 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 
274 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
294 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.77 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  41.73 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.77 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.74 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  43.7 
 
 
267 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 
255 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.63 
 
 
424 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
293 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  40.91 
 
 
267 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
490 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  41.25 
 
 
257 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  38.72 
 
 
266 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  42.68 
 
 
285 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  39.21 
 
 
258 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.82 
 
 
263 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.82 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.18 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  37.6 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.71 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  43.65 
 
 
264 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  42.32 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  37.45 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  40.82 
 
 
282 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0075  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein fecE  34.82 
 
 
291 aa  171  1e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
275 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.08 
 
 
302 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  37.45 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  42.4 
 
 
278 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  39 
 
 
418 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0032  ABC transporter related  44.49 
 
 
264 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  39.84 
 
 
273 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
273 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
277 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.94 
 
 
260 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2076  ABC transporter related  40.08 
 
 
319 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000611241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.23 
 
 
289 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  43.92 
 
 
266 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
262 aa  168  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
273 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
285 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  40.34 
 
 
263 aa  168  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.93 
 
 
273 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  39.04 
 
 
254 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.12 
 
 
266 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.37 
 
 
271 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
255 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
265 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  40.56 
 
 
255 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  39.52 
 
 
303 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  41.7 
 
 
267 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  39.33 
 
 
260 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
260 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  39.62 
 
 
272 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.63 
 
 
262 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  41.91 
 
 
255 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
264 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  43.3 
 
 
283 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  36.36 
 
 
259 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.88 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  40.33 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
265 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  43.62 
 
 
282 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  43.62 
 
 
282 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  39.39 
 
 
269 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3452  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
299 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  40.89 
 
 
268 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  38.16 
 
 
265 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  38.16 
 
 
265 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 
282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>