More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0465 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  58.04 
 
 
257 aa  319  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  47.51 
 
 
264 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  44 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  42.52 
 
 
261 aa  218  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
262 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  40.7 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  39.61 
 
 
279 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  38.4 
 
 
260 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 
250 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  43.33 
 
 
250 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 
255 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  39.04 
 
 
253 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
274 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.15 
 
 
258 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  41.9 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  42.53 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  37.8 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.42 
 
 
274 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  38.89 
 
 
261 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  36.78 
 
 
263 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.21 
 
 
255 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
262 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  35.6 
 
 
250 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
262 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  36.55 
 
 
262 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  36.55 
 
 
262 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.43 
 
 
268 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  35.85 
 
 
282 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  35.46 
 
 
253 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  36.25 
 
 
261 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
278 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
275 aa  174  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  39.37 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  36.8 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  35.43 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  36.22 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  34.92 
 
 
258 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  37.94 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  36.9 
 
 
273 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  37.71 
 
 
276 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  38.28 
 
 
271 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  33.86 
 
 
258 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  35.63 
 
 
271 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  38.58 
 
 
250 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  34.94 
 
 
263 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  34.94 
 
 
266 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.43 
 
 
267 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
266 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
250 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.15 
 
 
302 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  36.54 
 
 
267 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.55 
 
 
253 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.08 
 
 
625 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
293 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  33.58 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  34.83 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  38.01 
 
 
271 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  34.14 
 
 
266 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  34.73 
 
 
330 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  34.94 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  34.13 
 
 
252 aa  165  9e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  36.63 
 
 
264 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  36.86 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  38.08 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  33.72 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
258 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
266 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  35.71 
 
 
253 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  37.4 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.55 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  34.1 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  35.11 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
264 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
264 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
264 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
264 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
264 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  38.67 
 
 
270 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  36.9 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.43 
 
 
271 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  31.62 
 
 
252 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  35.11 
 
 
274 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  35.11 
 
 
274 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  35.32 
 
 
260 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  35.32 
 
 
253 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  34.52 
 
 
256 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  33.73 
 
 
250 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
277 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
257 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  35 
 
 
274 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  35.63 
 
 
273 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  35.5 
 
 
275 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  34.63 
 
 
258 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  37.13 
 
 
258 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>