More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2667 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  99.62 
 
 
262 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  87.02 
 
 
262 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  81.23 
 
 
266 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  81.54 
 
 
266 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  79.92 
 
 
263 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  77.39 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  71.76 
 
 
258 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  72.16 
 
 
258 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  71.76 
 
 
259 aa  357  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  72.16 
 
 
258 aa  357  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  71.76 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  68.24 
 
 
257 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  55.35 
 
 
276 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  51.92 
 
 
261 aa  258  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  49.6 
 
 
253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  46.72 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  43.43 
 
 
261 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  47.93 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  44.11 
 
 
263 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  42.64 
 
 
260 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  40.08 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  40.08 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
265 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  35.94 
 
 
250 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  33.99 
 
 
250 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  41.39 
 
 
269 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  39.29 
 
 
251 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
257 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  35.29 
 
 
275 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  36.25 
 
 
253 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  35.77 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  38.49 
 
 
274 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.69 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.46 
 
 
262 aa  152  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 
250 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.16 
 
 
255 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  36.58 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  35.17 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  37.14 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.84 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  39.67 
 
 
284 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.72 
 
 
271 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  34.54 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  33.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
279 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  35.86 
 
 
265 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
278 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  37.19 
 
 
267 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  40.08 
 
 
273 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.63 
 
 
267 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.41 
 
 
255 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  37.71 
 
 
286 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
265 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
250 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.84 
 
 
271 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.49 
 
 
271 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3868  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
270 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282288  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 
266 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  37.02 
 
 
282 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  36.51 
 
 
250 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  37.14 
 
 
278 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 
270 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  37.05 
 
 
266 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
275 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 
256 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
270 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
270 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  37.72 
 
 
255 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.2 
 
 
273 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  40.18 
 
 
252 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  36.59 
 
 
277 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  37.65 
 
 
313 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
270 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  34.51 
 
 
260 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.62 
 
 
268 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  36.9 
 
 
274 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
255 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
277 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  33.75 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>