More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1218 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  100 
 
 		 251 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  71.2 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  62.1 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  61.69 
 
 		 250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  56.57 
 
 		 249 aa  268  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  40.87 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  39.68 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 		 276 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  42.02 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  39.29 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 262 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  38.49 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.96 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  41.8 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  41.47 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  44.58 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  41.8 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  36.4 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  38.02 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  43.46 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  41.43 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  37.8 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  36.48 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  39.75 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2718  ABC transporter related  35.78 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.083198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.08 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2633  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  37.85 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  37.75 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  35.8 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  38.68 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.75 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  38.86 
 
 		 279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  31.05 
 
 		 252 aa  144  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  36.71 
 
 		 264 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.04 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  38.17 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  31.69 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  38.7 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.33 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  32.66 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  35.91 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  32.78 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  32.66 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  33.47 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  32.26 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  35.59 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.01 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  33.05 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  38.5 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  36.22 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.54 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  34.89 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  37.05 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  37.8 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  36.29 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.95 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.95 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  37.1 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  32.39 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  35.81 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  31.97 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  36.89 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.55 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  32.65 
 
 		 271 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>