More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1176 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  52.59 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  49.8 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  47.66 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  47.41 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  42.4 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  44.8 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  44 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  43.6 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  44.4 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  42.8 
 
 		 260 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  43.2 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  42.4 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  42.4 
 
 		 299 aa  217  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  42.57 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  44.84 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  40.87 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  41.5 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  42.23 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  42.13 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  40.56 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  39.53 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  37.35 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  37.45 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.55 
 
 		 418 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  39.92 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.82 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  40.91 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  35.34 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  35.32 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4898  ABC transporter-like  37.7 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  0.0112209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  36.28 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.08 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  34.54 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  39.33 
 
 		 444 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  36.86 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  33.86 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.92 
 
 		 258 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.05 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  34.94 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  35.96 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.15 
 
 		 424 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.92 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  36.33 
 
 		 266 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 		 418 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.94 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  36.84 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  38.17 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  34.75 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  33.45 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  34.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.69 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.82 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1169  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.69 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  32.03 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.95 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.95 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.95 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  35.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.95 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  35.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.6 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  33.33 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  30.83 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  34.9 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>