More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0027 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
265 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  43.68 
 
 
257 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  36.78 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  37.64 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  40.39 
 
 
263 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  34.98 
 
 
261 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.7 
 
 
255 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  39.1 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  36.59 
 
 
260 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.98 
 
 
258 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  37.66 
 
 
264 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  38.26 
 
 
254 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  35.88 
 
 
252 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  34.78 
 
 
258 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  41.55 
 
 
266 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
255 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  36.15 
 
 
258 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  39.92 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  38.28 
 
 
250 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  34.85 
 
 
258 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  37.96 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  36.44 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
278 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  38.43 
 
 
258 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
275 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  36.4 
 
 
254 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.34 
 
 
302 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  40.54 
 
 
263 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  37.19 
 
 
250 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  37.96 
 
 
266 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  37.45 
 
 
253 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 
262 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  36.96 
 
 
303 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  37.07 
 
 
253 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.21 
 
 
625 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.02 
 
 
455 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  37.04 
 
 
252 aa  149  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  37.14 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  32.95 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  37.05 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  37.14 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  35.44 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  35.77 
 
 
274 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0562  ABC transporter related  39.62 
 
 
264 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  39.91 
 
 
261 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  36.68 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  35.8 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36 
 
 
268 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  37.05 
 
 
253 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  34.5 
 
 
266 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  36.51 
 
 
273 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  33.98 
 
 
299 aa  145  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  34.46 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
262 aa  145  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  36.71 
 
 
251 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  37.16 
 
 
255 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 
271 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  32.24 
 
 
257 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
271 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 
264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  35.14 
 
 
259 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 
262 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 
264 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 
264 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 
264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  35.65 
 
 
265 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 
264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  37.32 
 
 
250 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  33.21 
 
 
282 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  32.56 
 
 
250 aa  142  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.24 
 
 
253 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  32.18 
 
 
292 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  36.04 
 
 
250 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  35.02 
 
 
260 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  32.44 
 
 
339 aa  142  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  31.95 
 
 
330 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  35.34 
 
 
255 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
255 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  35.34 
 
 
255 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 
279 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.34 
 
 
255 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  33.46 
 
 
254 aa  141  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  34.77 
 
 
252 aa  141  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.37 
 
 
258 aa  141  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  34.82 
 
 
275 aa  141  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>