More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1575 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2718  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.083198  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2633  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  99.62 
 
 
261 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.38 
 
 
258 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  39.59 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  37.3 
 
 
258 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  36.64 
 
 
253 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.25 
 
 
275 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  33.2 
 
 
261 aa  153  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  35.78 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  35.95 
 
 
271 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 
265 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  34.62 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  34.65 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  38.84 
 
 
258 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 
262 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  34.98 
 
 
252 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.08 
 
 
255 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  37.1 
 
 
260 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  34.32 
 
 
268 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  33.03 
 
 
236 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  33.73 
 
 
250 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  35.04 
 
 
250 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  37.25 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.45 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  35.29 
 
 
250 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  31.7 
 
 
268 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
265 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  31.54 
 
 
259 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 
276 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  33.99 
 
 
271 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  32.82 
 
 
265 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.77 
 
 
250 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  34.76 
 
 
249 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  32.82 
 
 
265 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  35.71 
 
 
299 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  33.94 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.2 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  34.78 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  34.41 
 
 
276 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  32.59 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  32.91 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  34.19 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  32.41 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  33.77 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  33.48 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  32.95 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  36.12 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
275 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  33.19 
 
 
250 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  35.71 
 
 
254 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  32.48 
 
 
252 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  33.03 
 
 
253 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  31.22 
 
 
266 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
264 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
265 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
264 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  31.43 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  31.5 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  34.07 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  33.05 
 
 
261 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
265 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  35.59 
 
 
253 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  34.04 
 
 
261 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  33.33 
 
 
259 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  35.32 
 
 
255 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.15 
 
 
418 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  34.75 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  30.74 
 
 
269 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.8 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  33.33 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  34.4 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  36.9 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3978  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.07 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  30.29 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  32.3 
 
 
270 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
265 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  33.05 
 
 
262 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  32.05 
 
 
263 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  33.61 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  31.56 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>