More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3057 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 250 aa  295  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  49.6 
 
 		 250 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  53.2 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  43.78 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  47.6 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  44.18 
 
 		 253 aa  258  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  43.37 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  45.2 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  49.2 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  46.99 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  46.43 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  47.18 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  45.34 
 
 		 299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  44.58 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  45.38 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  47.39 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  46.96 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  46.03 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  45.85 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  43.65 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  43.08 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 274 aa  211  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  43.64 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  43.85 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  43.5 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  42.28 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  43.36 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  42.02 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  37.9 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  41.87 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  41.67 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  37.8 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  38.65 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  33.46 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  40.53 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  38.65 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  38.79 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.13 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.34 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.45 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  36.36 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  38.25 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  37.1 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  38.43 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  38.62 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  39.42 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.67 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  37.39 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.72 
 
 		 409 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  36.97 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.98 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  36.13 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  36.19 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  37.1 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.14 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  37.5 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  41.43 
 
 		 333 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  36.65 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.44 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.09 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  39.24 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.09 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  38.6 
 
 		 424 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.43 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  35.95 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  35.95 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  35.86 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  35.86 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 293 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.65 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.87 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>