More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4420 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  71.2 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  61.13 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  60.73 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  56 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  39.38 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  41.25 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  36.65 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  36.25 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  35.29 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  40.31 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  42.22 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  36.25 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  34.92 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  36.58 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.06 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  38.06 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  40.08 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  38.13 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2718  ABC transporter related  36.64 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.083198  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2633  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  33.73 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  40.94 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.9 
 
 		 275 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.9 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.12 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 275 aa  151  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  36.61 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.84 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.99 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  33.86 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  37.96 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  35.48 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  37.05 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.6 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  37.55 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  38.93 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  34.96 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  39.63 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  30.52 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.2 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  36.93 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  36.11 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.46 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 278 aa  138  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.66 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  36.4 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  35.44 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  35.69 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  34.13 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  35.29 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.97 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  33.99 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  35.1 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  32.31 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  33.46 
 
 		 271 aa  134  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  35.8 
 
 		 299 aa  134  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  37.1 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  31.92 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  31.92 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  31.92 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>