More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2251 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  91.2 
 
 
250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  62.1 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  60.73 
 
 
253 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  52.85 
 
 
249 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  41.08 
 
 
261 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  43.53 
 
 
261 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  40.93 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  43.84 
 
 
260 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
257 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  40.78 
 
 
258 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
262 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  33.99 
 
 
262 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
262 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 
258 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  34.51 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  35.18 
 
 
266 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  33.6 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  34.77 
 
 
266 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  39.08 
 
 
261 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
266 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  38.08 
 
 
258 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  37.15 
 
 
253 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.85 
 
 
275 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  34.02 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  33.86 
 
 
263 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  36.36 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  37.25 
 
 
254 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  35.56 
 
 
258 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
255 aa  158  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  35.55 
 
 
273 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  36.05 
 
 
252 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
255 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37 
 
 
250 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  36.93 
 
 
257 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  36.45 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 
258 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 
259 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
258 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.72 
 
 
274 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  36.99 
 
 
250 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.74 
 
 
268 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  36.78 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  38.28 
 
 
264 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  36.58 
 
 
258 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  38.46 
 
 
254 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  35.62 
 
 
256 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  37.14 
 
 
269 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  41.48 
 
 
261 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.33 
 
 
262 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  34.67 
 
 
260 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  35.51 
 
 
253 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  36.57 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  36.65 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  34.58 
 
 
253 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  34.58 
 
 
260 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 
256 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  34.71 
 
 
276 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  32.79 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
262 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
278 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  31.4 
 
 
262 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  36.25 
 
 
262 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  35.06 
 
 
252 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  34.76 
 
 
252 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2718  ABC transporter related  33.73 
 
 
261 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.083198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
261 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
285 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
270 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2633  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  31.33 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  36.07 
 
 
284 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  36.05 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  35.34 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.04 
 
 
271 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  39.71 
 
 
250 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  33.19 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  34.74 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.36 
 
 
259 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  36.89 
 
 
250 aa  138  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.92 
 
 
418 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  32.46 
 
 
267 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  37.5 
 
 
253 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  34.02 
 
 
274 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  33.79 
 
 
258 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  32.37 
 
 
269 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>