More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3221 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  87.02 
 
 
262 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  87.02 
 
 
262 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  86.64 
 
 
262 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  84.56 
 
 
266 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  83.14 
 
 
266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  81.54 
 
 
263 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  79.84 
 
 
266 aa  417  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  70.98 
 
 
258 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 
258 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  70.98 
 
 
259 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 
258 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  70.98 
 
 
258 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  67.06 
 
 
257 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  53.67 
 
 
261 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  54.74 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  50.8 
 
 
253 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  44.22 
 
 
261 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  44.96 
 
 
263 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  45.02 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  46.64 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  40.87 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  40.48 
 
 
251 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  42.21 
 
 
269 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  36.65 
 
 
253 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  34.51 
 
 
250 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  42.08 
 
 
260 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  34.77 
 
 
250 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
257 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  38.12 
 
 
279 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.51 
 
 
258 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.31 
 
 
274 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.03 
 
 
275 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  36.07 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 
267 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.4 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
271 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.46 
 
 
262 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  35.18 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  35.18 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
250 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
271 aa  148  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
266 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.27 
 
 
261 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  37.9 
 
 
252 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  37.79 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  34.4 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  31.64 
 
 
256 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  37.45 
 
 
250 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.68 
 
 
255 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  38.36 
 
 
264 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  36.51 
 
 
254 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  39.51 
 
 
284 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  36.55 
 
 
267 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.77 
 
 
258 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  31.4 
 
 
254 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
263 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  36.47 
 
 
263 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
264 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 
255 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  33.88 
 
 
455 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  33.72 
 
 
275 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  38.22 
 
 
293 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  34.58 
 
 
259 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  34.89 
 
 
276 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
279 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  36.61 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  39.2 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  36.93 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  37.98 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.19 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  33.46 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  36 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  36.1 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 
271 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3868  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
270 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282288  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  35.04 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  32.07 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  33.46 
 
 
258 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.65 
 
 
271 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
264 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
264 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  35.19 
 
 
258 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
266 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
264 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
264 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  36.65 
 
 
274 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  36.36 
 
 
273 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>