More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1088 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  100 
 
 
299 aa  617  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  58.4 
 
 
255 aa  295  9e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  54.44 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  51.61 
 
 
252 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 
250 aa  276  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  53.23 
 
 
276 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  52.42 
 
 
255 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  50.81 
 
 
250 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  52.42 
 
 
250 aa  269  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  52.42 
 
 
260 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  50.2 
 
 
252 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  53.62 
 
 
256 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  46.8 
 
 
253 aa  245  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  46.4 
 
 
253 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  46.4 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  48.79 
 
 
259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  45.34 
 
 
250 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  46.37 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  44.8 
 
 
252 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  47.79 
 
 
254 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  42.23 
 
 
258 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  43.78 
 
 
261 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  44.18 
 
 
252 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
272 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  41.77 
 
 
275 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
255 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
274 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  42.49 
 
 
258 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  42.49 
 
 
258 aa  195  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.52 
 
 
274 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  39.76 
 
 
258 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
262 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  40.56 
 
 
268 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  38.34 
 
 
262 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  40.85 
 
 
274 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  39.33 
 
 
255 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  40.73 
 
 
254 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 
262 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
259 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  38.06 
 
 
258 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  37.55 
 
 
269 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  38.1 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  38.49 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
257 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.22 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  39.57 
 
 
247 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3868  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
270 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282288  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
275 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
262 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
268 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.59 
 
 
259 aa  159  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0298  ABC transporter related  38.4 
 
 
272 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
264 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.9 
 
 
267 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.57 
 
 
418 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.21 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
293 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  33.6 
 
 
262 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
256 aa  155  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 
259 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
265 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.84 
 
 
258 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.57 
 
 
253 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
278 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  32.95 
 
 
273 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
256 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  33.72 
 
 
274 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1908  ABC transporter related  36.73 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.8 
 
 
257 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  33.33 
 
 
253 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  37.13 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  35.04 
 
 
259 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
272 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  32.68 
 
 
272 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.84 
 
 
266 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
272 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
272 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  34.82 
 
 
290 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 
272 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 
272 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  39.63 
 
 
340 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 
272 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.43 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  32.55 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.13 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.13 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.57 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  34.01 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  35.29 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  34.12 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  37.13 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>