More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0799 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  49.61 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  49.81 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  46.88 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  45.45 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  42.64 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  43.25 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  42.25 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  43.95 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  43.08 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  42.91 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  43.14 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  42.13 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  41.2 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  36.58 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  36.36 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  36.36 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.75 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  43.31 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  35.8 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.47 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  31.64 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.61 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  32.67 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  32.14 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  32.23 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  37.17 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  30.29 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  31.54 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  30.71 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  36.43 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  34.92 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 490 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  30.38 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  32.65 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  35.19 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  32.52 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2633  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476214  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  36.29 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  31.17 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  33.33 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2718  ABC transporter related  34.19 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.083198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  30.95 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  32.49 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  33.2 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  35.11 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  36.91 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  33.2 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  35.51 
 
 		 536 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  28.51 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  29.8 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  34.17 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  32.49 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  30.29 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.79 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  35.18 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  38.37 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  28.63 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  29.05 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  31.82 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  31.89 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  30.13 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  31.89 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  32.55 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  28.22 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.48 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  37.6 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  33.46 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  31.82 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  32.23 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.55 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  31.06 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  31.06 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  28.1 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  31.35 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  28.03 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  32.33 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>