More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0407 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  96.84 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  96.84 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  82.14 
 
 
252 aa  427  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  57.03 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  55.02 
 
 
255 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
250 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  54.62 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  50 
 
 
260 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  52.21 
 
 
254 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  48.02 
 
 
252 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  43.37 
 
 
250 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  46.37 
 
 
250 aa  251  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  44.44 
 
 
252 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  46.77 
 
 
259 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  46.4 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  43.2 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 
276 aa  242  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  44.27 
 
 
258 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  43.82 
 
 
252 aa  236  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  45.87 
 
 
262 aa  232  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  45.83 
 
 
255 aa  229  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
255 aa  221  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  43.57 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  46.58 
 
 
258 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 
262 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  46.25 
 
 
258 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
274 aa  215  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  42.11 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  43.21 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.4 
 
 
274 aa  211  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  38.49 
 
 
274 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.15 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  37.24 
 
 
254 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
257 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 
262 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.29 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.29 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  38.66 
 
 
250 aa  182  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  41.6 
 
 
247 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  38.24 
 
 
250 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  39.68 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  39.68 
 
 
275 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
268 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
275 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.26 
 
 
253 aa  175  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
259 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.72 
 
 
409 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  35.71 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  35.39 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.7 
 
 
418 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  39.84 
 
 
258 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  38.19 
 
 
258 aa  170  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  36.51 
 
 
253 aa  168  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  35.71 
 
 
253 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
278 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  33.73 
 
 
444 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 
418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  34.05 
 
 
249 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.58 
 
 
259 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  35.71 
 
 
264 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  32.95 
 
 
384 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  37.24 
 
 
253 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
266 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  32.3 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  31.84 
 
 
252 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
265 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  34.96 
 
 
253 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  34.96 
 
 
252 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  34.13 
 
 
264 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  31.33 
 
 
262 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  32.26 
 
 
252 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.57 
 
 
266 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  35.16 
 
 
268 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  36.91 
 
 
269 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  33.21 
 
 
264 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  37.14 
 
 
268 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  35.69 
 
 
285 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
301 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  33.33 
 
 
262 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  32.92 
 
 
293 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  32.64 
 
 
258 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  33.33 
 
 
269 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  39.09 
 
 
260 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
269 aa  155  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  34.33 
 
 
271 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  34.6 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  37.45 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  33.07 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.51 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  34.3 
 
 
254 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  32.94 
 
 
293 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
272 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>