More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2569 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  497  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  52.38 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  50.99 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  47.93 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  48.37 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  48.11 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  44.63 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  44.35 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  45.27 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  43.48 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  47.88 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  40.78 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  45.67 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  45.28 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  39.61 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  46.96 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  44.58 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  43.65 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.38 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  40.94 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  41.44 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.59 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  43.39 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  39.16 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  38.68 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.91 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  43.78 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  36.93 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  40.62 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  33.46 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  40.43 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  41.53 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  39.58 
 
 		 286 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  38.58 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  39.58 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.21 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.5 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  38.58 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  39.38 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.43 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  38.93 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  41.11 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  39.75 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  37.65 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  36.89 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  36.48 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  34.32 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.84 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  44.02 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  41.91 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  36.07 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.76 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.76 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.76 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  41.63 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  41.63 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  36.28 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.92 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.15 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  33.88 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  40.37 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  36.36 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  34.94 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  33.05 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  38.14 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  36.89 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.37 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  37.71 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>