More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4769 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  50.8 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  50.62 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  49.6 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  48.84 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  51.82 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  50.78 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  50.76 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  48.21 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  49.41 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  43.85 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  50.99 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  46.88 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  43.75 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  44.58 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  37.94 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  42.46 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  37.15 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  42.06 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  44.36 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  44.71 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  41.8 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  36.36 
 
 		 275 aa  161  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  37.19 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.82 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  43.97 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  39.26 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.94 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.49 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  41.53 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  38.13 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  36.94 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  38.52 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  36.44 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.06 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  37.39 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  36.89 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  39 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.25 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  38.52 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.57 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  38.17 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  35.46 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.96 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.66 
 
 		 268 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.96 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  43.46 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  38.8 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  35.86 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  38.08 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  44.49 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 274 aa  144  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  39.15 
 
 		 265 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.92 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  39.66 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  35.51 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  40.93 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  39.11 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  35.88 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  34.24 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  33.06 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  40.54 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  38.27 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  43.03 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  41 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  37.75 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  41.39 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  32.78 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  41.67 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>