More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0757 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  93.39 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  48.99 
 
 
252 aa  239  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  44.94 
 
 
252 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  46.25 
 
 
260 aa  228  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  48.51 
 
 
254 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  46.44 
 
 
252 aa  221  9e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  47.08 
 
 
253 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 
250 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  46.67 
 
 
253 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  46.25 
 
 
260 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  45.06 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  44.94 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 
255 aa  209  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  44.53 
 
 
255 aa  208  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  42.28 
 
 
250 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
250 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  43.35 
 
 
259 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  42.49 
 
 
299 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  42.92 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  39.83 
 
 
252 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
272 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  38.8 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  41.39 
 
 
252 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  41.3 
 
 
275 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  38.93 
 
 
274 aa  186  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  41.39 
 
 
274 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  41.2 
 
 
262 aa  184  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  39.83 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  39.69 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
256 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  41.94 
 
 
258 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  39.83 
 
 
247 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  41.84 
 
 
258 aa  171  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
262 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
272 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  39 
 
 
266 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  39.48 
 
 
250 aa  168  9e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  39.91 
 
 
250 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  41.11 
 
 
418 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
269 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
255 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  40.71 
 
 
253 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  39 
 
 
266 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
257 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  36.86 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.01 
 
 
255 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.14 
 
 
269 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  38.03 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
275 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 
418 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  40.47 
 
 
253 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 
268 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0814  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
260 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  39.69 
 
 
253 aa  159  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
253 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  35.32 
 
 
270 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.55 
 
 
264 aa  158  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
266 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
536 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  33.47 
 
 
444 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
265 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  37.61 
 
 
249 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  37.71 
 
 
268 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  39.09 
 
 
375 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  37.35 
 
 
258 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.56 
 
 
405 aa  154  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.98 
 
 
259 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 
276 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  36.65 
 
 
266 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  36.02 
 
 
278 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  34.47 
 
 
258 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  39.92 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
264 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.77 
 
 
267 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  40 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  39.46 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  35.37 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  37.55 
 
 
262 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  37.18 
 
 
271 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
265 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  37.61 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  34.45 
 
 
307 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.41 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  34.41 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  34.41 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  36.13 
 
 
264 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  36.65 
 
 
266 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
259 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  34.41 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  34.17 
 
 
256 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.24 
 
 
269 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.97 
 
 
409 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
251 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.39 
 
 
251 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>