More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2074 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  84.85 
 
 
271 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  52.69 
 
 
272 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  52.53 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.53 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  45.61 
 
 
269 aa  229  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  54.55 
 
 
256 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  47.43 
 
 
256 aa  225  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  46.43 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  46.03 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  43.35 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  46.22 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  44.86 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  47.04 
 
 
264 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  46.22 
 
 
266 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  41.34 
 
 
260 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  47.19 
 
 
276 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  41.67 
 
 
268 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  45.34 
 
 
264 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  48.94 
 
 
245 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  41.91 
 
 
260 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.3 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  43.22 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  39.46 
 
 
262 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  45.71 
 
 
261 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  50.42 
 
 
245 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
269 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
245 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  48.26 
 
 
274 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  40 
 
 
285 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
277 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  37.82 
 
 
280 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  44.09 
 
 
261 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  47.16 
 
 
261 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  36.64 
 
 
259 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  47.16 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  40.51 
 
 
260 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
252 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
256 aa  178  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
252 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 
256 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  35.25 
 
 
258 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 
242 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  38.12 
 
 
253 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 
259 aa  175  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.19 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  39.68 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  35.12 
 
 
277 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
269 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  36.4 
 
 
259 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.6 
 
 
260 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  38.49 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  40.08 
 
 
258 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 
255 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.69 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  38.82 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.75 
 
 
255 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.75 
 
 
255 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.75 
 
 
255 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
255 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  34.94 
 
 
257 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  39.52 
 
 
262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  35.32 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  33.73 
 
 
257 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 
255 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
272 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  36.11 
 
 
414 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
265 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  35.6 
 
 
290 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  38.4 
 
 
259 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  38.59 
 
 
266 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
265 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 
269 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
263 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  36.58 
 
 
257 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.4 
 
 
258 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  37.05 
 
 
260 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  39.74 
 
 
284 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 
271 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.73 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.19 
 
 
405 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  39.37 
 
 
270 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  38.3 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.71 
 
 
418 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  38 
 
 
266 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  37.04 
 
 
274 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  40.66 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  37.93 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
293 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
254 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.91 
 
 
262 aa  153  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 
267 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
259 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.15 
 
 
289 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  42.98 
 
 
251 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.43 
 
 
271 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.82 
 
 
266 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>