More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0814 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0814  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  33.33 
 
 
252 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
274 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  34.78 
 
 
258 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  33.74 
 
 
254 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.54 
 
 
255 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 
262 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  36.95 
 
 
249 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  34.94 
 
 
258 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  34.57 
 
 
252 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  38.36 
 
 
261 aa  153  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.35 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  38.33 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  31.97 
 
 
252 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.73 
 
 
258 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  37.33 
 
 
274 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
250 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
275 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  34.29 
 
 
259 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 
262 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  34.18 
 
 
259 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  32.79 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.86 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  34.66 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  33.47 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  31.23 
 
 
253 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  34.52 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
259 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  31.23 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  31.78 
 
 
299 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
265 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  30.43 
 
 
260 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  32.02 
 
 
254 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  35.51 
 
 
250 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
255 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.44 
 
 
259 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  35.98 
 
 
256 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  35.06 
 
 
257 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
264 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  34.84 
 
 
283 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  34.57 
 
 
260 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  34.26 
 
 
266 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.71 
 
 
258 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  34.84 
 
 
283 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  32.67 
 
 
375 aa  142  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
262 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  32.49 
 
 
254 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  31.73 
 
 
253 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  34.8 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.73 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  35.29 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  33.6 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  34.54 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  32.92 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  33.08 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  33.89 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  35.87 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  34.58 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  34.58 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  33.33 
 
 
259 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  30.08 
 
 
276 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  31.58 
 
 
250 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  31.08 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  32.53 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  35.02 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  36.25 
 
 
384 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
263 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  33.74 
 
 
278 aa  138  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  36.62 
 
 
282 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  35.15 
 
 
271 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  35.87 
 
 
268 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  35.56 
 
 
255 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  31.67 
 
 
274 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  34.45 
 
 
265 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 
252 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  36.15 
 
 
280 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  30.4 
 
 
253 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  32.4 
 
 
252 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.89 
 
 
268 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  31.84 
 
 
455 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  30.4 
 
 
253 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
536 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  32.35 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  33.76 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0175  ABC transporter related  36.89 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  30 
 
 
262 aa  135  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  30.96 
 
 
293 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  30.8 
 
 
414 aa  135  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  33.48 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  33.73 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  31.54 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  35.62 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  32.95 
 
 
313 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  28.98 
 
 
250 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>