More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1298 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  99.6 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.4 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0533  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  37.65 
 
 		 490 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  40.51 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.75 
 
 		 409 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  38.98 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  42.37 
 
 		 455 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  38.84 
 
 		 494 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  40.68 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  43.72 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  43.72 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  39.58 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  36.51 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.66 
 
 		 424 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  42.13 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  42.13 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.08 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  39.42 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  38.2 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.66 
 
 		 625 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.24 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  34.38 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.92 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  35.98 
 
 		 284 aa  174  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  39.5 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.59 
 
 		 418 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.19 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  37.97 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  35.29 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  38.75 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  38.75 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  35.71 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  39.58 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  36.67 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  35.71 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  36.13 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  37.97 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  36.13 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  35.71 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  33.06 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.08 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  37.4 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  34.45 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  35.42 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  37.5 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  32.64 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.29 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  39.51 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  36.67 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>