More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2122 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  49.02 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  50 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 293 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  45.08 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.98 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.53 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  32.8 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  39.92 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.04 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  38.25 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  37.35 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  42.79 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  34.58 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  43.59 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 490 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  42.97 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  38.11 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.98 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  35.54 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  38.65 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.06 
 
 		 409 aa  168  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.57 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  40.48 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  36.25 
 
 		 282 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  38.4 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.47 
 
 		 418 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  31.87 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 536 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  38.27 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  39.53 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.62 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  38.58 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  39.83 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  40.64 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  39.45 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.85 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  32.23 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  41.22 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  32.23 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  40.51 
 
 		 419 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  39.83 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  37.02 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  36.93 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 261 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.13 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  37.2 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  41.53 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  37.08 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  38.68 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  38.29 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  37.2 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  39.41 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  37.55 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  35.43 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.19 
 
 		 405 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.16 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  42.15 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  37.3 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  39.54 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  36.89 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  31.93 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.24 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.3 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.3 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.6 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.3 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  44.59 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  42.92 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  37.9 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>