More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1284 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  53.64 
 
 
266 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  52.67 
 
 
269 aa  287  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  44.02 
 
 
260 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  46.12 
 
 
256 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  46.51 
 
 
257 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  46.51 
 
 
257 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.98 
 
 
322 aa  225  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  42.64 
 
 
278 aa  225  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  42.47 
 
 
265 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  43.02 
 
 
264 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  42.91 
 
 
258 aa  217  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
276 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  44.27 
 
 
274 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  46.15 
 
 
271 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  44.96 
 
 
261 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  41.63 
 
 
278 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
269 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  42.44 
 
 
261 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  44.98 
 
 
263 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.98 
 
 
263 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  36.4 
 
 
262 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  41.22 
 
 
260 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  41.8 
 
 
266 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.28 
 
 
256 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  37.6 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
259 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
277 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 
256 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
260 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  40.79 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  40.08 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  38.49 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  42.97 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  39.15 
 
 
256 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
252 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  32.96 
 
 
285 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 
256 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
290 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
252 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  36.78 
 
 
277 aa  175  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  34.43 
 
 
259 aa  175  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.1 
 
 
260 aa  175  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  38.63 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  42.5 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
257 aa  169  6e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
242 aa  168  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  43.16 
 
 
252 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  35.59 
 
 
266 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  34.85 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  37.1 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.39 
 
 
444 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  39.15 
 
 
260 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  32.08 
 
 
259 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  40.25 
 
 
245 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.46 
 
 
418 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  39.08 
 
 
266 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
275 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
257 aa  157  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  32.5 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.1 
 
 
266 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.33 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.22 
 
 
269 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  32.38 
 
 
253 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  33.06 
 
 
254 aa  152  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.89 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  32.38 
 
 
253 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  39.75 
 
 
264 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 
248 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  34.84 
 
 
421 aa  149  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.68 
 
 
255 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.02 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  33.71 
 
 
424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  37.71 
 
 
266 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  34.48 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  33.61 
 
 
427 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 
268 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  35.9 
 
 
267 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  35.37 
 
 
260 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  35.02 
 
 
274 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  36.1 
 
 
255 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  34.89 
 
 
259 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  34.32 
 
 
283 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  37.55 
 
 
262 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  33.47 
 
 
280 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
296 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
296 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  35.17 
 
 
296 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 
266 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  32.2 
 
 
285 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  35.29 
 
 
264 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0797  ABC transporter related  38.84 
 
 
318 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>