More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2736 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  75.69 
 
 
256 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  75.29 
 
 
257 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  75.29 
 
 
257 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  68.73 
 
 
261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  54.69 
 
 
260 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  51.76 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  60.57 
 
 
261 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  56.27 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  46.59 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  50.97 
 
 
265 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  47.08 
 
 
285 aa  245  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  49.81 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
269 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  51.22 
 
 
322 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 
256 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
257 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  45.91 
 
 
266 aa  232  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  43.03 
 
 
277 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  50.6 
 
 
261 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 
256 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  42.86 
 
 
268 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
277 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  44.96 
 
 
276 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  44.22 
 
 
266 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  41.54 
 
 
262 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  51.05 
 
 
257 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  48.18 
 
 
271 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  45.88 
 
 
272 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  46.64 
 
 
278 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  46.78 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  41.08 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  41.9 
 
 
260 aa  211  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  43.48 
 
 
259 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  46.85 
 
 
253 aa  210  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
276 aa  208  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
245 aa  207  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  48.02 
 
 
266 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  46.06 
 
 
253 aa  203  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  47.24 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  45.24 
 
 
263 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.24 
 
 
263 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.35 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  37.85 
 
 
259 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 
261 aa  193  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  40 
 
 
280 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  36.99 
 
 
253 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
259 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  37.66 
 
 
260 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  44.66 
 
 
279 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  42.39 
 
 
257 aa  188  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.17 
 
 
229 aa  178  9e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
257 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  38.8 
 
 
268 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.93 
 
 
258 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  41.98 
 
 
245 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.52 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  40.24 
 
 
254 aa  169  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  38.08 
 
 
268 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  44.26 
 
 
252 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.69 
 
 
259 aa  168  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.76 
 
 
268 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
259 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  42.98 
 
 
254 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  40.32 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  47.26 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.7 
 
 
444 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 
257 aa  166  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.24 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  41.41 
 
 
255 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.61 
 
 
266 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
490 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.67 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.61 
 
 
264 aa  162  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  40.24 
 
 
256 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  42.32 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  42.4 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.29 
 
 
262 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
242 aa  162  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40.8 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.39 
 
 
259 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  35.55 
 
 
268 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  38.74 
 
 
424 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  35.14 
 
 
284 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.4 
 
 
271 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  43.03 
 
 
250 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>