More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3223 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  55.13 
 
 		 265 aa  291  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  54.23 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  52.34 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  47.43 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.27 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  56.27 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  44.57 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  56.63 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  54.09 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  54.09 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  44.36 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  54.32 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  44.35 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  52.67 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  44.27 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  44.26 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  42.02 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  46.31 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  46.28 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  48.26 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  42.25 
 
 		 277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  41.92 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  46.47 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  43.98 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  38.02 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  40.73 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  38.34 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  45.9 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  45.37 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.68 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  39.26 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  43.44 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  38.91 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  41.13 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  38.75 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  36.64 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  43.15 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.15 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  43.51 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.8 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.43 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  38.8 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.03 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.54 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  37.25 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  38.4 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  36.97 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  38.19 
 
 		 324 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  39.77 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.21 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.32 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  43.33 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  33.73 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  37.85 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.56 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  38.98 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  36.19 
 
 		 284 aa  161  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  34.66 
 
 		 409 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  39.18 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  39.42 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 		 418 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  36.19 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  36.65 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  35.97 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  36.08 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  37.84 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>