More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1463 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  62.89 
 
 
279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  59.38 
 
 
278 aa  324  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  45 
 
 
278 aa  235  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  45.1 
 
 
263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.1 
 
 
263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 
276 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  46.64 
 
 
271 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
261 aa  229  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  44.57 
 
 
260 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
245 aa  226  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  42.64 
 
 
268 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  42.05 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
269 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  47.24 
 
 
256 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
256 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  47.06 
 
 
257 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  43.19 
 
 
260 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  47.06 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
256 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  44.36 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  40.15 
 
 
262 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.25 
 
 
322 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  40.46 
 
 
285 aa  206  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  45.53 
 
 
245 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  43.62 
 
 
256 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  47.24 
 
 
261 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  44.07 
 
 
252 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  44.07 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  43.03 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  40.93 
 
 
265 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  38.76 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  38.58 
 
 
277 aa  198  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  40.54 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  39.3 
 
 
259 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
257 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.15 
 
 
260 aa  191  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  40.08 
 
 
253 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  39.2 
 
 
266 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  42.08 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 
242 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 
252 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  37.89 
 
 
259 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  38.4 
 
 
261 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  43.21 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  38.82 
 
 
258 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  41.18 
 
 
257 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  43.63 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  36.59 
 
 
258 aa  176  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  40.08 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  43.22 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.83 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  37.7 
 
 
262 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  39.75 
 
 
276 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 
257 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  39.38 
 
 
274 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.95 
 
 
253 aa  168  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 
251 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.55 
 
 
268 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  36.36 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.07 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.96 
 
 
409 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  37.15 
 
 
253 aa  163  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  37.15 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  36.25 
 
 
265 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  37.24 
 
 
257 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  34.47 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.44 
 
 
405 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  36.93 
 
 
266 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  35.02 
 
 
444 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
268 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
264 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  37.14 
 
 
266 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  38.52 
 
 
252 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  35.32 
 
 
260 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  36.48 
 
 
252 aa  159  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  34.84 
 
 
253 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  33.61 
 
 
255 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  36.21 
 
 
260 aa  158  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 
267 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
265 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  35.69 
 
 
268 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  35.57 
 
 
253 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.59 
 
 
258 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
274 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.75 
 
 
258 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  33.2 
 
 
257 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.6 
 
 
266 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  35.18 
 
 
253 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  34.17 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  34.78 
 
 
260 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
490 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>