More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0528 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  60.42 
 
 
245 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 
276 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  48.31 
 
 
278 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  48.73 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  48.95 
 
 
257 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  48.95 
 
 
257 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  47.84 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  49.17 
 
 
256 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.96 
 
 
263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  46.96 
 
 
263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  46.19 
 
 
265 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  50.22 
 
 
252 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  41.08 
 
 
262 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  47.26 
 
 
279 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  44.44 
 
 
260 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  41.6 
 
 
278 aa  185  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  41.45 
 
 
268 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  44.07 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  44.07 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
260 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  42.04 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  35.77 
 
 
253 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  44.73 
 
 
384 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 
245 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
290 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  42.37 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  41.48 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  39.57 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  47.68 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  44.53 
 
 
266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  38.14 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  37.08 
 
 
280 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
256 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  45.99 
 
 
274 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  47.08 
 
 
261 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  43.7 
 
 
271 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  48.23 
 
 
261 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  39.06 
 
 
260 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
242 aa  166  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.1 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  40.53 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  43.23 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  35.47 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
256 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  37.92 
 
 
285 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  37.04 
 
 
256 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
269 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  41.91 
 
 
257 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  42.36 
 
 
271 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.41 
 
 
262 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  43.1 
 
 
253 aa  159  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
252 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  39.57 
 
 
268 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  45.23 
 
 
247 aa  158  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
259 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.71 
 
 
405 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.68 
 
 
268 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.67 
 
 
414 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.89 
 
 
322 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  43.1 
 
 
253 aa  156  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.3 
 
 
264 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  34.18 
 
 
270 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
257 aa  156  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.36 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
264 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.18 
 
 
266 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  35.81 
 
 
259 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  46.03 
 
 
251 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
265 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.45 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.19 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  36.44 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.42 
 
 
424 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 
269 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  35.44 
 
 
263 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
490 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.08 
 
 
266 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.98 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.08 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.97 
 
 
444 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  41 
 
 
271 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 
255 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.92 
 
 
274 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  35.66 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
266 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  36.44 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  38.75 
 
 
265 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.64 
 
 
253 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1310  ABC transporter related  30.64 
 
 
254 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  42.32 
 
 
247 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.9 
 
 
251 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 
268 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>